藥品穩定性試驗箱主要控制模擬活體內環境相關的3個基本變量：穩定的CO2水平、溫度、相對濕度。要有穩定的培養環境，就要考慮這三方面的影響因素，選購時，就應該對這些“重中之重"有一定的了解才能選到適合自己的儀器。但是，其它的一些方面的“小"因素也不能忽略，因為這些都會影響儀器的使用價值和壽命。選購時，就應該從各方面的因素加以考慮。
1.溫度控制：
保持藥品穩定性試驗箱內恒定的溫度是維持細胞健康生長的重要因素。當選購二氧化碳培養箱時，有兩種類型的加熱結構可供選擇：氣套式加熱和水套式加熱。雖然這兩種加熱系統都是和可靠的，但是它們都有著各自的優點和缺點。水套式培養箱是通過一個獨立的熱水間隔間包圍內部的箱體來維持溫度恒定的。熱水通過自然對流在箱體內循環流動，熱量通過輻射傳遞到箱體內部從而保持了溫度的恒定。*的水套式設計有其優點：水是一種很好的絕熱物質，當遇到斷電的時候，水套式系統就能更可靠地長久保持培養箱內的溫度準確性和穩定性(維持溫度恒定的時間是氣套式系統的4-5倍)。
此外，有些類型的二氧化碳培養箱還具備外門及輔助加熱系統，這個系統能加熱內門，提供給細胞良好的濕度環境，保證細胞滲透壓維持平衡，且可有效防止形成冷凝水以保持培養箱內的濕度和溫度。如果您的培養環境需要的控制，那么這個輔助系統則是*的。
2.CO2控制：
CO2 濃度探測可通過兩種控制系統——紅外傳感器(IR)或熱傳導傳感器(TC)進行測量。當二氧化碳培養箱的門被打開時，CO2從箱體內漏出，此時傳感器就會探測到CO2濃度的降低，并做出及時的反應，重新注入CO2使其恢復到原先預設的水平。熱傳導傳感器(TC)監控CO2濃度的工作原理是通過測量兩個電熱調節器(一個調節器暴露于箱體環境內，另一個則是封閉的)之間的電阻變化來實現的。箱內CO2濃度的變化會改變兩個電熱調節器間的電阻，從而促使傳感器產生反應以達到調節CO2水平的作用。TC控制系統的一個缺點就是箱內溫度和相對濕度的改變會影響傳感器的度。
3.相對濕度控制：
培養箱內相對濕度的控制是非常重要的，維持足夠的濕度水平才能保證不會由于過度干燥而導致培養失敗。大型的二氧化碳培養箱是用蒸汽發生器或噴霧器來控制相對濕度水平的，而大多數中、小型培養箱則是通過濕度控制面板(humidity pans)的蒸發作用產生濕氣的(其產生的相對濕度水平可達95-98％)。一些培養箱有一個能在加熱的控制面板上保持水份的濕度蓄水池(humidity reservoir)，這樣可以增強蒸發作用，此蓄水池能增加相對濕度水平達97-98％。但是，這個系統也更復雜，由于復雜結構的增加一些難以預料的問題也會在使用過程中出現。
4.微處理控制系統：
每一個使用者都希望所用的儀器能夠方便好用，微處理控制系統和其它各種功能附件(如高溫自動調節和警報裝置、CO2警報裝置、密碼保護設置、自動校準系統等等)的運用，就使得二氧化碳培養箱的操作和控制都非常的簡便。微處理控制系統是維持培養箱內溫度、濕度和CO2 濃度穩態的操作系統。例如PIC微處理器控制系統，它能嚴格控制氣體的濃度并將其損耗降低水平，以保證培養環境恒定不變，且能保證長期培養過程中箱內溫度，并有LED 顯示，可設置、校正溫度和CO2濃度。不同的微處理系統雖然名字不相同，但是其原理與控制效果則無甚區別，培養箱選購時不必太在意它們名字上的區別，關鍵是要自己覺得使用起來方便，容易操作，而且要能夠達到所需的控制精度。
5.污染物的控制：
污染是導致細胞培養失敗的一個主要因素，因而，二氧化碳培養箱的制造商們設計了多種不同的裝置去減少和防止污染的發生，其主要途徑都是盡量減少微生物可以生長的區域和表面，并結合自動排除污染裝置來有效防止污染的產生。
6.其它因素：
每一類型的二氧化碳培養箱溫度、濕度和CO2 濃度的控制范圍和控制度、均一度都有所不同。
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